En mi primer trabajo como primer autor se describieron las condiciones de cultivo y metodológicas necesarias para poder aplicar al pneumococo -Streptococcus pneumoniae- la técnica del "pelado" de células vivas con proteasas que tan buenos resultados le permitió obtener a mi director de tesis doctoral, Manuel José Rodrígue Ortega y que se tradujo en una publicación en la prestiosa revista Nature Biotechnology. Este fue el primer paso para, posteriormente, poder aplicar esta aproximación a la identificación de proteínas de superficie de una batería de aislados clínicos de adultos y niños, con el hándicap inicial de los fenómenos de autolisis y fraticidio descritos en esta especie. El fin, desde el primer momento, fue el desarrollo de herramientas de diagnóstico rápido y la detección de proteínas de superficie que fuesen potenciales candidatos para su ensayo como vacunas. Actualmente estas vacunas están basadas en la reacción frente a la cápsula polisacarídica, lo que repercute en un alto precio de producción (y comercialiación) y en la efectividad, puesto que la plasticidad genotípica del neumococo da lugar a reemplazamientos serotípicos hacia estirpes que no están cubiertas por las vacunas gracias a que es capaz de desarrollar fenómenos de transformación natural que implican reemplazamientos en la naturaleza molecular de su cápsula. Por ello, se partió de la hipótesis de que proteínas que estuvieran conservadas en la mayoría de los clones (clasificación basada en genes constitutivos, no en la naturaleza molecular de la cápsula), fuesen accesibles a anticuerpos (para lo que debían de estar presentes en la superficie celular, que son las que se identifican -o se pretenden identificar mayoritariamente con la técnica del "pelado"-), se tornaran como fundamentales en el proceso que desencadena la enfermedad (pero no la colonización, que se ha demostrado que confiere protección cruzada entre clones) y fuesen capaz de desarrollar una respuesta celular además de la humoral, serían las mejores candidatas.

A pesar del hándicap de partida de la autolisis y fraticio que suponen una contaminación de las muestras de proteínas de superficie con otras de naturaleza citosólica, con este trabajo se concluyó que sería posible aplicar la aproximación descrita, si bien con unos ratios de proteínas de superficie/proteínas totales inferiores a los descritos por mi director de tesis trabajando con Streptococcus pyogenes.

El artículo original se puede encontrar en http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874391912002588.